SARS-COV-2 OMICRON使用的TMPRSS2用法改变了感染力和融合性

　　在这里，我们从尖峰介导的免疫逃避，ACE2结合相互作用和细胞进入途径的角度检查了Omicron的生物学特性，这些途径可能决定了组织的偏爱。首先，我们已经表明，Omicron Spike赋予了对疫苗诱发的中和抗体的实质性逃避，这对于Chadox-1与BNT162B2疫苗血清相比更大。在纵向抽样的参与者中，通过第三剂量的mRNA疫苗接种减轻了二剂量减弱，该疫苗在短期内还增加了Omicron的中和中和。该观察对于在全球范围内通知三剂疫苗接种工作至关重要。值得注意的是，Chadox-1在低收入环境中广泛使用，在低收入环境中，第三剂mRNA疫苗并非广泛使用，除非可以实施第三剂，否则Omicron可能会导致此类环境中更高的感染率。低收入国家的进一步关注是，除了不良的Delta中和外，所有九名参与者两剂冠状动脉均缺乏对血清中的Omicron的中和活性。　　就对中度至重度临床疾病的治疗选择的影响而言，我们显示出对OMICRON广泛使用的单克隆抗体组合治疗REGN2对OMICRON的体外活性的高水平丧失，但是聚合酶抑制剂remdesivir和Molnupiravir的活性降低了。据报道，单克隆抗体sotrovimab可以保留针对球体11,35的显着体外活性。　　尽管存在三种突变，这些突变被预测有利于S1/S2裂解，但与Delta和WT Wuhan-Hu-1 D614G相比，感染活病毒的细胞中观察到的尖峰裂解较低。同样，与三角洲相比，活的Omicron Virions的分裂尖峰比例较低。裂解缺乏在PV颗粒中也很明显。我们先前指出，与Virions相比，细胞内切割的尖峰的比例较低，这表明将尖峰掺入内质网中产生的病毒体中 - 高尔基菌中间室中的中间室可能有利于裂解的尖峰而不是全长尖峰，或者像病毒体被裂解，因为病毒体是通过Exocytociletiolity Pathways pation pation sejection。　　与细胞培养系统中的三角洲相比，活的OMICRON病毒显示出明显的复制缺陷，其中TMPRSS2存在。OMICRON SPIKE还与在靶下低气道器官，胆囊器官或表达TMPRSS2的CALU-3肺细胞中相对于WT和Delta Spike蛋白的入口减少有关，但在TMPRSS2表达较低的细胞中没有差异，例如H1299，HELA-HELA-ACE2，HELA-ACE2和293t-ace2和293t-a2细胞。我们开始直接比较在ACE2过表达的细胞中的进入，其中TMPRSS2要么被击倒或过表达，并表明Omicron进入不受TMPRSS2表达的变化影响，而且与WT和Delta Spike PV输入相比。重要的是，当ACE2未表达过表达时，我们观察到Delta PV进入具有TMPRSS2的可用性的大幅度增加，并且Omicron的入口增加了得多。这些数据表明TMPRSS2辅助因子使用可能会受ACE2水平的影响。Omicron Spike的假设改变了其对依赖组织蛋白酶依赖性内体的进入途径（TMPRSS2独立）的偏好是通过对PV和Live Virus分离株中的calter蛋白和TMPRSS2的抑制剂实验来表达的。　　TMPRSS2是II型跨膜丝氨酸蛋白酶家族的成员。这个家庭包括17名具有不同生理功能的成员。这些蛋白需要激活并与膜保持相关，而TMPRSS2尤其可以进行自催化活化37，尽管其在人体生理学中的作用尚不清楚。TMPRSS2已被证明是SARS-COV-1和MERS以及SARS-COV-2的辅助因子（参考文献3,38）。重要的是，TMPRSS2的依赖性与S1/S2之间的PBC的有效裂解相关（参考文献22,23），并且在SARS-COV-2中删除了Furin-Covage位点，从而降低了TMPRSSS2依赖性。相比之下，在将液裂裂解位点引入SARS-COV-1中的实验中，该病毒表现出更大的TMPRSS2依赖性。　　Omicron提出了与SARS-COV-1的有趣相似之处，由于缺乏PBC，它在生产细胞中没有切割，而是在TMPRSS2或内体中的组织蛋白酶在目标细胞表面上。SARS-COV-1能够感染细胞，而TMPRSS2（因此可以诱导合胞体）29或通过内吞作用3,23。SARS-COV-2 OMICRON变体似乎也有利于内吞作用，通过降低尖峰的裂解效率损害了TMPRSS2介导的入口。实际上，Omicron中的累积突变包括多种其他碱性氨基酸，导致S蛋白的总电荷增加。这种变化可能会使S对低ph诱导的构象变化更加敏感，并且是一种适应性的适应，可促进使用低ph内体入口途径，和/或适应在上呼吸道的下pH环境中进入。此外，我们对人呼吸道组织样品的单细胞RNA-seq数据集和直接qPCR测量的分析表明，与上呼吸道中发现的细胞相比，肺细胞具有更高的TMPRSS2 mRNA。实际上，最近的数据表明，使用叙利亚仓鼠模型39，在深肺组织中的病毒负担较低，并且Omicron与Delta感染的致病性降低。　　如预期的那样，生产细胞中尖峰的次级裂解以及有效的尖峰裂解与使用TMPRSS2进行细胞入口/细胞 - 细胞融合的能力之间的已知联系，我们观察到Omicron Spike蛋白具有低核基因势。这种现象可能会转化为细胞 - 细胞扩散受损，实际上，我们观察到Omicron的斑块大小与Delta相比，在该系统中，无细胞感染受到半稳态培养基的限制。OMICRON的较小焦点大小可能归因于未能诱导合成症，而不会损害进入效率，因为观察到了相似数量的焦点。半固体培养基可防止无细胞感染，因此我们的测量应主要反映通过合成症形成在有限的时间内传播的感染。但是，较小的灶可能在体内具有不同的含义。首先，由于细胞死亡的较少，病毒产生可能降低，因此有利于Omicron而不是三角洲。另外，合成症以及细胞存活和较大的感染灶可能会增加扩散，从而有利于三角洲。合成症的结局差异可能是细胞和组织依赖性的，我们警告不要将这些体外感染数据推断为呼吸道中的病毒载荷。　　我们的数据显示了类器官系统和人鼻上皮培养物中imicron的差异差异受到它们在体外系统中的限制，尽管使用了原发性人体组织。还要注意，TMPRSS2的水平可能会影响ACE2，特别是因为TMPRSS2与ACE2裂解40有关，并且我们的效应大小受ACE2表达的影响。最后，E64D除了宿主细胞组织蛋白酶外还可以抑制病毒蛋白酶，这可能影响了观察到的表型的强度。　　总而言之，在TMPRSS2表达的细胞（例如肺泡中的细胞）中，OMICROR已获得了免疫逃避特性，以及损害了合成症的形成，这是一种与Vivo降低的致病性性质一致的特征的组合。至关重要的是，Omicron的经验表明，仅基于序列的复制和向潮流的预测可能会产生误导，并且对复杂突变的表型影响的详细分子理解是至关重要的，因为变体继续出现。

本文来自作者[lejiaoyi]投稿，不代表言希号立场，如若转载，请注明出处：https://lejiaoyi.cn/zlan/202506-1147.html